Окончил «ДГМА» в 2003 году, а в период с 2005 по 2006 год — проходил клиническую интернатуру на базе «РКБ», по специальности — «Общая хирургия».
Затем в период 2006–2008 гг. проходил клиническую ординатуру «РГМУ» г. Москва на базе 2 городской больницы. В 2009 г. — стал аспирантом, и в 2013 г. — закончил аспирантуру во 2 Московской городской больнице.
С 2013 года Ибрагимов Шамиль Ибрагимович — «кандидат медицинских наук».
Как врач, он не ограничивается отличным полученным образованием, а постоянно участвует в конференциях, конгрессах, проходит программы повышения квалификации.